Με CWM δεν χάνεις τα ΟΤΑ. Παίρνεις ειδοποίηση, τα κατεβάζεις άλλα δεν γίνονται εγκατάσταση.
Αν κάνεις Root με τα προγράμματα εκτός από τα extra bloadware που περνάνε, περνάνε και malwares όπως το MtkCamera.
Ο καλύτερος τρόπος, ώστε να μην χάσεις και τα ΟΤΑ, είναι να flashαρεις CWM, να κάνεις Root από το CWM και μετά να ξαναflashαρεις την stock recovery.
Για να μην χάνεις το root με κάθε OTA πρέπει να ενεργοποιησεις την "Λειτουργία Επιβίωσης" στον SuperSU αφού πρώτα ενεργοποιησεις το "Ενεργοποίηση Pro".